租用孵化器辦公室的風險主要體現在兩方面：一孵化器辦公室是否合法？二是孵化器辦公室不合法的話，公司會承擔什么責任？公司的股東是否會因此承擔責任？

孵化器辦公室是否合法。

關于公司的住所，公司登記條例規定：“公司的住所是公司主要辦事機構所在地。經公司登記機關登記的公司的住所只能有一個。公司的住所應當在其公司登記機關轄區內。”無論是有限公司還是股份公司，設立登記時需提交的材料均為“公司住所證明”。公司與孵化器辦公室的提供方簽訂的合同，一般包含了公司租用提供方的物業開辦公司的意思表示，盡管平均下來份額很少，使用起來也沒有自有辦公室方便，但是仍然符合公司登記條例的要求。工商部門往往以孵化器辦公室沒有實體經營場所為由，認定孵化器辦公室違法，這是故意混淆了企業登記中的“住所”和“經營場所”這兩個概念，不能以工商部門的個別違法執法行為推定孵化器辦公室違法。

實際上，工信部、財政部、工商總局2012年7月12日發布的《關于大力支持小型微型企業創業興業的實施意見》（工信部聯企業〔2012〕347號）第三條規定：“放寬對經營場所的限制。按照法律法規規定的條件、程序和合同約定，允許創業者將家庭住所、租借房、臨時商業用房等作為創業經營場所。申辦個體工商戶無法提交經營場所產權證明的，申請人可以持市場主辦單位、各類園區的管委會（居委會、村委會）出具的同意在該場所從事經營活動的相關證明，辦理注冊登記。”盡管該條可能與物權法的相關規定沖突，有隨意執法的嫌疑，但結合各地工商部門近兩年開展的“集中辦公區”試點，表明目前公司登記相當容易了。

公司股東是否會因此承擔責任。

如果工商部門認定公司使用孵化器辦公司作為住所是不合法的，面臨的行政處罰是吊銷營業執照和撤銷公司登記（公司法第199條）。公司被撤銷登記或者吊銷營業執照的，公司因此解散（公司法第181條），股東應按照公司法的規定對公司進行清算，公司的債權債務清理完畢后，即可向工商部門申請注銷公司登記。即便清理后發現公司資不抵債，股東只要不存在其他可能導致否定人格的情形，無需對此承擔責任。對公司的債權人而言，要么放棄債權，要么申請破產。

總之，股東不會因為公司使用孵化器辦公室而承擔民事責任。這是2005年公司法的進步之處，公司經工商部門登記成立即具備法人資格，無論其登記事項是否有瑕疵。而根據1994年公司法，瑕疵設立的公司是不具備法人資格的，公司被撤銷登記或吊銷營業執照的，自始即無法人資格，股東應對公司的債務承擔無限連帶責任。